时速超过1600公里的飞碟频繁出现地球上空，与此同时一种怪病在地球蔓延。人类科学家浅山博士（高松政雄 饰）发现其中秘密，未免引起慌乱而秘不声张。来自月球背面的怪星人意欲劫持博士，被埃姆拉德行星的正义使者钢铁巨人（宇津井健 饰）救下。 　　此后不久，怪星人再次以一种干扰人类神经的超声波发动进攻。人类社会迅速成立对策委员会，决定与钢铁巨人联合对抗入侵。 　　参与深见博士（中村彰 饰）被怪星人劫持，不久后浅山与深见的孩子们亦被虏去，地球人和怪星人的战斗正式开始……